Parque Nacional Marino Archipiélago Golfo de Fonseca, ubicado en el municipio de Amapala.La ballena azul es uno de los residentes temporales, de la zona, que escogen las aguas de la zona en las temporadas de invierno.
Área de Manejo de Hábitat por Especie Bahía de Chismuyo, esta ubicado entre los municipios de Nacaome y Alianza.
Área de Manejo de Hábitat por Especie Bahía de San Lorenzo, ubicado entre los municipios de San Lorenzo y Marcovia (Choluteca).
Dentro de los límites de estas áreas protegidas se hace observación de aves, insectos, anfibios, reptiles, mamíferos, cabalgatas, montañismo, puedes salir en lanchas y conocer los manglares de Honduras, estos bosques de mangle son poco conocidos.
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